Добрый день.
Проверьте, пожалуйста, включена ли у вас настройка "Сохранять настройки в файл при выходе" (Система/Настройки/Основные настройки/Программа/Файлы настроек).
Проверьте, пожалуйста, включена ли у вас настройка "Сохранять настройки в файл при выходе" (Система/Настройки/Основные настройки/Программа/Файлы настроек).