Как записать строку в файл в определенное место. Не в конец, а например в третью строку файла?

Прямого пути нет

Можно сделать так (очень условно):

text = {}
f=io.open(file,"r")
for line in f:lines() do
table.insert(text,line)
end
f:close()

table.insert(text,3,"Вставляемая строка")

f=io.open(file,"w")
for _,line in ipairs(text) do
f:write(line .. "\n")
end
f:close()