Как влияет кол-во неиспользуемых функций в файле индикатора

На самом деле, количество используемых функций влияет на производительность.
Поясняю:
Если функции глобальные, то указатели на них помещаются в глобальную таблицу , что увеличивает ее размер и соответственно поиск по ней требуемой функции.
Если функция локальная, то она увеличивает локальную таблицу и аналогично выше сказанному
если применить предварительную выборку функции, то это требует добавку кода, что влияет на производительность.
-----------------
Таким образом, в общем случае количество функций влияет на производительность.

но скорее всего это влияние практически незаметно.
Большее влияние это оказывает на общее число функций особенно локальных.

Ну если хотите подробно рассмотреть вопрос, то начните с момента
каким образом луа определит есть ли такой хеш или это новый?  
И ответьте влияет ли на это  число существующих функций.

поясняю:
Смотрим API вызов функций:
----------------------
lua_getglobal(L, "f"); /* вызываемая функция */ lua_pushliteral(L, "как"); /* 1-й аргумент */
-------------------
lua_getglobal(L, "t"); /* таблица для индексирования */
---------------------
итд
---------------------
Во всех случаях мы указываем имя функции и(или)  имена переменных как строки.
-------------------  
Смотрим  исходный код например LUA 5.3 (особой разници нет так как это у всех версий луа одинаково)
если хорошо искать,
то найдет функцию которая создаст кэш нашей строки и проверит новая это строка или нет
===============
TString *luaS_new (lua_State *L, const char *str) {
unsigned int i = point2uint(str) % STRCACHE_N; /* hash */
int j;
TString **p = G(L)->strcache[i];
for (j = 0; j < STRCACHE_M; j++) {
if (strcmp(str, getstr(p[j])) == 0)
return p[j];
}
for (j = STRCACHE_M - 1; j > 0; j--)
p[j] = p[j - 1];  p[0] = luaS_newlstr(L, str, strlen(str));
return p[0];
}
Не сложно увидеть в этой функции циклы по глобальной таблице.
Кроме того, второй цикл занимается перемещением элементов.
----------------------
Очевидно чем больше таблица и дальше по ней наша строка, тем дольше поиск.
------------------------
В итоге, по-моему мнению,
число функций, как и число переменных,
влияет не только на затраты памяти,
но и на производительность т е загрузку процессора.
-----------------

В качестве совета начинающим.
---------------------------
В луа вызов функций самая тяжелая операция (в смысле затрат времени процессора).
---------------------
Поэтому, если очень хотите экономить время,
то вставляйте код функции там,
где хотите вызвать функцию.
--------------------
Безусловно это приведет к затратам памяти.
------------------------
На самом деле, все не так уж и страшно.
---------------------------
Если Вы начинающий,
то у Вас будут существенно большие затраты и памяти и времени
процессора из-за неоптимальности вашего алгоритма и выбираемых Вами методов.