Изменение стоп-заявки

При отправке стоп-заявки переменная Param_sdelki["PRICE_CLOSE_STOP"] = 0. Затем в OnTrade если стоп-заявка срабатывает то ей присваивается цена:
function OnTrade(TABLE_trade)
    --номер стоп-заявке тоже присваивается с этим проблем нет
    if TABLE_trade.trans_id==Param_sdelki["NUM_USER_STOP"] then
         if bit_set(TABLE_trade.flags, 0)==false and bit_set(TABLE_trade.flags, 1) == false then
              --стоп заявка исполнилась
              Param_sdelki["PRICE_CLOSE_STOP"]=TABLE_trade.price --итоговая цена закрытия стоп заявки
         end
    end

И даже проверка переменной (if Param_sdelki["PRICE_CLOSE_STOP"]=0) не всегда помогает.  

попробую еще это добавить в условие

номер транзакции я сравнивал с пользовательским номером стоп заявки, значит это неправильно?

Нет. Номер стоп-ордера - это его номер. После его активации устанавливается лимитный ордер, номер которого будет записан в таблице стоп-ордеров, в поле linkedorder.
Соответственно сделки будут приходить по ордеру с этим номером.

В идеальном мире:
При активации стоп-ордера придет колбек OnStopOrder. Для своего стоп-ордера увидите заполненное поле linkedorder.
При совершении сделок по этому ордеру придут колбеки OnTrade, где в поле order_num будет тот же номер, что и в linkedorder.

В реальном мире, в теории, колбек OnStopOrder с заполненным linkedorder может прийти после колбека OnTrade. Правда, с учетом того что OnTrade приходит не один раз, то синхронизация возможна.

В любом случае схема такая
стоп ордер - linkedorder - ордер с этим номером - сделки по этому ордеру.

Правда при работе с стоп ордерами всегда важно помнить, что стоп ордера - это просто триггер. Он всего лишь отправляет транзакцию при активации. А исполнится ли лимитный ордер или останется висеть неисполненным, или он будет отвергнут ядром биржи - это уже "проблема индейцев". Т.е. это Вы должны контролировать что случилось после активации стоп-ордера. Иначе позиция может так и остаться не закрытой.